Posibles Temas de Estudio

Salvo algunos sistemas virales, en los organismos autónomos mas simples (procariontes) aun no conocemos para que codifica toda la información genética, ya no digamos la comprensión de las interacciones funcionales de los compuestos celulares, ni su interacción con el ambiente. Sin embargo, de manera optimista, considero que se puede trabajar para recrear a mediano plazo, de manera controlada, los procesos biológicos más simples y/o la modificación sustancial de sistemas actuales para entender su performance bajo diferentes condiciones ambientales.
Debido a lo anterior, en la actualidad se pueden ubicar dos grandes enfoques de estudio:
I. La caracterización funcional de sistemas biológicos simples (E. coli) que incluye el entender la interacción funcional de la red de regulación genética, la percepción ambiental, y el resetting transcripcional del genoma de E. coli (J. Collado, MA. Rámirez, CCG-UNAM).
II. Diseñar un sistema biológico desde sus planos iniciales. Este es un trabajo en el cual estamos más lejos. En este sentido los procesos que requerimos estudiar son varios, algunos son:
1. Formación y estudio de miscelas como un medio de contención físico para un sistema celular.
2. Caracterización funcional de extractos celulares (E. coli) para llevar a cabo la transcripción y traducción (en las miscelas)
3. Identificación del programa genético mínimo para un sistema autónomo (que incluya el control de la duplicación y mantenimiento de la información genética, además de la información regulatoria de los procesos celulares)
4. Caracterización y modelado de un metabolismo mínimo requerido
5. Caracterización y modelado de los mecanismos requeridos para la comunicación con el ambiente (transdución de señales, sistemas de transporte y secreción, etc.)